LPPM STAIMAS Wonogiri menjalankan program strategis yang diarahkan pada penguatan tri dharma perguruan tinggi, khususnya dalam bidang penelitian dan pengabdian kepada masyarakat. Program dirancang secara terarah, berkelanjutan, dan berorientasi pada kebutuhan nyata masyarakat serta perkembangan ilmu pengetahuan.
Program-program LPPM meliputi hibah penelitian internal, pembimbingan penulisan artikel ilmiah, pendampingan KKN mahasiswa, serta pengelolaan jurnal ilmiah yang terakreditasi.
Pelaksanaan penelitian dan pengabdian kepada masyarakat di STAIMAS Wonogiri berpedoman pada Rencana Induk Penelitian (RIP) dan Rencana Strategis (Renstra) LPPM yang disusun secara periodik dan mengacu pada kebijakan nasional dari Kementerian Agama Republik Indonesia.
Setiap kegiatan penelitian dan pengabdian wajib memenuhi standar etika akademik, prosedur administrasi, dan pelaporan yang ditetapkan dalam panduan resmi LPPM STAIMAS Wonogiri.